Nel Medioevo, in prossimità delle cale portuali, erano darsene, ospizi e arsenali degli ordini monastico-cavallereschi. Templari, cavalieri di San Giovanni, teutonici, lazzariti avevano a Brindisi le proprie basi operative funzionali al rifornimento dei presidi cristiani, non solo in Terra Santa, ma anche nei Balcani. Di tutto questo unico relitto, si direbbe, rimane l'ospedale che era dei cavalieri di San Giovanni, ma che probabilmente in precedenza era stato dei Templari. Si tratta del complesso di San Giovanni dei Greci, oggi denominato Casa del Turista. Della chiesa rimangono solo frammenti, una parte del bastamento absidale, perché la chiesa fu demolita per dar luogo al palazzo Cocotò, poi Bono, poi Ina. All’interno del palazzo sono comunque ancora visibili resti della chiesa, perché Cocotò li riutilizzò come elementi nella nuova costruzione.
L'area archeologica che è alle mie spalle è un'area in cui sono presenti elementi dell'età romana, ma anche dell'età medievale, Com’è noto, nel Medioevo si seppelliva nei sagrati, cioè nella terra consacrata intorno alle chiese. Questo giustifica il ritrovamento di sepolture medievali in tutta la parte antica della città. Per altro verso, la presenza di resti romani documenta in modo eloquente l'espansione dell'abitato che si ebbe oltre le mura. Di questo abbiamo un esempio anche lungo via Montenegro, dove all'esterno della cinta fortificata della città si vede bene lo svilupparsi di domus. Il complesso ospitaliero doveva avere un aspetto imponente. Lo descrive molto analiticamente lo storico brindisino Giovanni Maria Moricino,
ma del resto occorre pensare che per i cavalieri di San Giovanni, che poi sarebbero quelli che oggi sono denominati i cavalieri di Malta, Brindisi era una base logistica importantissima. In realtà la scelta di Brindisi trovava ostacoli in Venezia, che non voleva all’imbocco dell'Adriatico la presenza di una grande flotta. Per Venezia il golfo di Venezia cominciava sulla linea ideale che univa Brindisi a Corfù. Oltre quella linea, qualunque presenza di una flotta, veniva considerata ostile. Quindi i veneziani mai hanno voluto l'insediamento di una base militare a Brindisi, tant'è che gli spagnoli alla fine opteranno per una strategia di dissuazione con la costruzione delle grandi fortezze sull'isola di Sant'Andrea, proprio per il veto veneziano relativo alla presenza di una flotta a Brindisi.